bakterije (grč. βαϰτηρία: batina, palica), mikroskopski sitni jednostanični organizmi s prokariotskom građom stanice (→ prokarioti); proučava ih bakteriologija. Posjeduju dvolančanu DNK poput zatvorene kružne omče koja nije obavijena jezgrinom opnom. Prosječni je promjer bakterijskih stanica oko 1 μm. Carstvo prokariota (Procaryotae) obuhvaća jednostanične i kolonijalne oblike različitih bakterija, a postoje dva gl. tipa: arheobakterije (Archaeobacteria – prastare bakterije) i eubakterije (Eubacteria – prave bakterije).
Arheobakterije
Arheobakterije
se prema građi stanice razlikuju od eubakterija; njihove citoplazmatske membrane sadrže neobične lipide a ribonukleinska kiselina (RNK) u ribosomima razlikuje se građom od RNK u ribosomima eubakterija. Arheobakterije obuhvaćaju tri skupine: metanogene (stvaraju plin metan), ekstremne halofile (žive u staništima s visokim postotkom soli) i termoacidofile (žive u okolišu visokih temperatura i sniženih pH-vrijednosti). Drži se da arheobakterije nalikuju prapočetcima života na Zemlji te da su predstavnici oblika iz kojih su se poslije, tijekom evolucije, razvili viši oblici.
Prave bakterije
Prave bakterije
ili, uobičajeno, bakterije imaju ekvivalent jezgre (nukleoid), ribosome i citoplazmatske membrane, a većina i posebno građenu staničnu stijenku, koja osigurava stalan oblik stanice. Imaju vanj. dodatne strukture: kapsulu, citoplazmatske uklopine, bičeve i dlačice (fimbrije ili pili). Prema obliku stanica razlikuju se štapićaste bakterije ili bacilarni oblici (lat. bacillum: štapić), kuglaste ili koki (lat. coccus: bobica), izvijeni oblici (lat. spirillum: spiralni oblik), arkula, slične kutijici (lat. arcula: kutijica), te zvjezdasti oblici, astra (grč. ἀστήρ: zvijezda).
Kapsula je želatinozni, tanji ili deblji sluzasti ovoj stanice, izgrađen od polisaharida ili polipeptida; taj ovoj štiti stanicu od isušivanja, djelovanja antibiotika i kem. sredstava, od fagocita, a služi i za pričvršćivanje na tvrde površine i udruživanje bakterija u agregate. U nekih patogenih bakterija služi za njihovo prihvaćanje na crvena krvna zrnca.
Bičevi su duži izdanci stanice kojima se bakterije aktivno pokreću u tekućoj sredini. S obzirom na položaj bičeva razlikuju se monotrihni tip (bič smješten na jednom polu stanice), lofotrihni tip (više bičeva na jednom polu stanice), amfitrihni tip (više bičeva na oba pola stanice) te peritrihni tip (mnogo bičeva po cijeloj površini stanice). Usklađeni rad bičeva dolazi do izražaja u važnim životnim situacijama, tj. kada se bakterije aktivno kreću vrlo brzo prema izvoru hrane ili se nastoje udaljiti od izvora nepovoljnih utjecaja.
Površina bakterija može biti gusto pokrivena sitnim dlačicama fimbrijama ili pilima, o funkciji kojih se još nagađa, ali se čini da se one s pomoću njih međusobno sljepljuju u nakupine ili se pričvršćuju na krute površine. Poseban, dugi nastavak, tanji od bičeva, kroz koji se tijekom spolnog načina razmnožavanja prenosi genetski materijal iz stanice u stanicu, zove se seksualni pili ili F-pili (od engl. fertility: plodnost).
Stanična stijenka je ovoj koji okružuje protoplast i tvori potporni skelet bakterijske stanice, koji joj osigurava stalan oblik (štapićast, okrugao, spiralan i dr.) te štiti stanicu od negativnih djelovanja promjena osmotskoga tlaka i mehan. ozljeda. Prema građi stanične stijenke razlikuju se Gram-pozitivne (oboje se bojom gencijana violet) i Gram-negativne bakterije (ne oboje se bojom gencijana violet) (→ gram, ch. j.). Ta je osobina bitna pri određivanju bakterija. Stijenka Gram-pozitivnih bakterija sadrži daleko veći postotak (95%) mureina (lat. murus: zid, stijenka) nego Gram-negativnih bakterija (5 do 12%). Murein je peptidoglikan, polimer specifične građe, koji se nalazi samo u prokariota, a sama stanica (protoplast okružen citoplazmatskom membranom) nalazi se u velikoj molekuli mureina, kao u vreći. Murein je više ili manje porozan, tako da kroz njega u stanicu mogu ući hranjive tvari te npr. boje i alkohol, dok, naprotiv, deblji sloj toga spoja u stijenci Gram-pozitivnih bakterija znači teže prolaznu barijeru. U stijenci Gram-pozitivnih bakterija nalaze se još teikoične kiseline, a u Gram-negativnih gl. dio stanične stijenke tvore lipopolisaharid, lipoproteini i fosfolipidi. Postoje i bakterije bez stanične stijenke mikoplazme.
Protoplast bakterijske stanice okružen je citoplazmatskom membranom (CPM), polupropusnom ovojnicom, kroz koju se osigurava sav promet tvari u stanicu i iz stanice. CPM luči u okoliš izvanstanične (ekstracelularne) enzime, koji razgrađuju velike molekule hrane u manje dijelove kako bi oni mogli ući u stanicu i postati izvorom energije. Energija potrebna za odvijanje životnih funkcija proizvodi se također u CPM-u, a mnogi ubori (invaginacije CPM-a zvane mezosomi) povećavaju aktivnost CPM-a u procesima staničnoga disanja i proizvodnji energije. U fotosintetskih bakterija, koje troše svjetlosnu energiju za svoje životne procese (asimilacija ugljičnog dioksida i stvaranje organske tvari), ubori CPM-a sadrže bakterioklorofil, pigment koji omogućuje spomenute procese, poput klorofila u zelenih biljaka.
U citoplazmi bakterija raspršeni su mnogobrojni ribosomi na kojima se odigrava sinteza proteina stanice. Bakterijski ribosomi građeni su od ribonukleinske kiseline i proteina, a mnogo su manji i manje gustoće od ribosoma eukariotskih stanica.
U sr. dijelu bakterijske citoplazme nalazi se nukleoplazma s bakterijskim kromosomom (nukleoidom), nositeljem svih nasljednih svojstava bakterije. On izgleda kao višestruko sklupčana, zatvorena kružna omča sastavljena od dvostruke uzvojnice nukleotida. Tijekom stanične diobe bakterijska se DNK udvaja (replikacija).
Neke vrste bakterija stvaraju spore (endospore), koje nastaju tako što se na jednom kraju stanice zgusne citoplazma i oko nje stvori debeo omotač koji sadržava dipikolinsku kiselinu, otpornu na vanj. utjecaje, posebno visoke temperature. Spore preživljavaju kuhanje na 100 °C više od 30 min, isušivanje medija u kojem žive dugo vrijeme (desetak godina), otporne su na kem. sredstva, ne propuštaju nikakva bojila. Nakon bojenja uobičajenim metodama spore izgledaju kao dobro vidljiva izdužena, jajasta ili okrugla tjelešca koja jako lome svjetlost.
Bakterije se razmnožavaju ugl. dijeljenjem stanice (binarno cijepanje) u dvije stanice kćeri, od kojih svaka dobiva istu količinu udvostručenoga genetičkog i staničnog materijala. Mogu se razmnožavati i spolnim načinom, koji obuhvaća prijenos genetičkog materijala iz jedne stanice u drugu. Spolni način obuhvaća tri tipa: konjugaciju, transformaciju i transdukciju.
Prema načinu dobivanja energije i korištenja izvora ugljika razlikuje se nekoliko gl. metaboličkih tipova bakterija, pri čemu se osim podjele na autotrofe i heterotrofe ističe i izvor energije te donor (davatelj) elektrona. Npr. pojam »fotolitoautotrofi« označava bakterije koje rabe Sunčevu energiju, donor elektrona je anorganski spoj, a izvor ugljika ugljični dioksid. Najveći broj bakterija pripada skupini kemoorganoheterotrofa, koji energiju za život osiguravaju oksidacijom org. spojeva, a oni su također donori elektrona i ugljika. Među njima se razlikuju saprofiti i paraziti.
Saprofiti razgrađuju mrtvu organsku tvar i tako osiguravaju odvijanje životnih ciklusa na Zemlji. Često se nazivaju samo heterotrofnim bakterijama. Svojim izvanstaničnim enzimima saprofitske bakterije cijepaju velike molekule bjelančevina, ugljikohidrata i drugih spojeva u sastavne, anorganske spojeve, koje biljke ponovno iskorištavaju za sintezu org. spojeva.
Na osnovi produkata koje stvaraju razgradnjom org. tvari, razlikuju se fiziološke skupine bakterija, npr. amonifikatori stvaraju iz bjelančevina amonijak, reducenti nitrata nitrit, celulolitičke bakterije razgrađuju celulozu, proteoliti razgrađuju proteine, denitrifikatori reduciraju nitrate i dr. Paraziti su bakterije koje žive u organizmu čovjeka, životinja i biljaka, često uzrokujući bolesti, pa se zato nazivaju patogenim bakterijama. One tvore samo malen dio bakterijskoga carstva.
Razgradnja org. tvari i kruženje materije i energije u prirodi odvijaju se vrlo intenzivno, unatoč mikroskopski malenim stanicama bakterija, i to zato što bakterije cijelom površinom svoje stanice sudjeluju u svim procesima izmjene tvari. Kako je brojnost bakterija velika, tako svaka bakterijska stanica povećava sveukupnu aktivnu površinu. U jednom gramu plodne zemlje ima oko 2,5 × 109 bakterija, u otpadnim vodama naselja ima ih na milijune u 1 cm³. Ta golema aktivna površina pretvara org. spojeve u tlu u anorganske, a njih iskorištavaju biljke. Razgradnja org. spojeva u onečišćenim vodama pretvara vode ponovno u čiste tijekom procesa samočišćenja. Bakterije mogu razgraditi sve spojeve biogenog podrijetla. U nizu tehnol. postupaka iskorištavaju se svojstva bakterija da, razgrađujući određene supstrate, stvaraju nove proizvode, vrlo korisne čovjeku, npr. u prehr. industriji (kiseljenje mlijeka, proizvodnja sirova, proizvodnja alkohola, octa i dr.), u proizvodnji antibiotika, bioplina.
Bakterije se istražuju posebnim metodama, a osnovno je načelo uzgoj čistih kultura na krutim ili tekućim hranilištima (podlogama) u sterilnim uvjetima. Pod čistim kulturama bakterija razumijevaju se populacije koje su se na hranjivoj podlozi razvile iz jedne stanice ili agregata istovrsnih stanica izoliranih iz krvi, urina, vode, mulja, tla itd.
Sistematika bakterija
Osnovni kriteriji za pristup svrstavanju bakterija u jednu od 35 skupina prikazanih u tabeli jesu: 1) oblik (morfologija), 2) bojenje po Gramu, 3) odnos prema kisiku (aerobi, anaerobi) i 4) sposobnost stvaranja spora. Pošto se utvrdi pripadnost pojedinoj skupini, s pomoću pribora koji omogućuje rutinsko obavljanje dvadesetak i više biokem. testova, utvrđuju se biokem. svojstva izoliranih, čistih kultura bakterija kao što su: fermentacija ugljikohidrata (laktoza, glukoza, saharoza, škrob, maltoza i dr.), hidroliza želatine, škroba, stvaranje indola, sumporovodika, rast na citratu, rast na krvnom agaru, razgradnja celuloze, pokretljivost i dr. Ti testovi omogućuju određivanje bakterija i do vrste. U novije doba bakterije se sistematiziraju prema različitim genetskim testovima.
Sistematika bakterija prema Bergeyevu sustavu (1994)
35 skupina bakterija s nekim podskupinama i pojedinim rodovima
skupina 1 |
spirohete
Spirochaeta, Treponema, Borrelia, Leptospira |
skupina 2 |
aerobne/mikroaerofilne, pokretne zavojite/vibroidne Gram‑negativne bakterije
Spirillum, Campylobacter, Helicobacter |
skupina 3 |
nepokretne (ili rijetko pokretne), Gram‑negativne, zakrivljene bakterije
Spirosoma |
skupina 4 |
Gram‑negativni aerobni/mikroaerofilni štapići ili koki
Pseudomonas, Azotobacter, Rhizobium, Acetobacter, Legionella, Neisseria, Flavobacterium, Brucella, Bordetella, Francisella, Moraxella |
skupina 5 |
fakultativni anaerobni Gram‑negativni štapići
podskupina 1:
porodica Enterobacteriaceae Escherichia, Klebsiella, Proteus, Providencia, Salmonella, Serratia, Shigella, Yersinia |
|
podskupina 2:
porodica Vibrionaceae
Aeromonas, Plesiomonas, Vibrio |
|
podskupina 3:
porodica Pasturellaceae
Haemophilus, Pasturella |
|
podskupina 4:
ostali rodovi
Eikenella, Gardnerella, Streptobacillus |
skupina 6 |
anaerobni, Gram‑negativni, ravni, zakrivljeni i zavojiti štapići
Leptotricha, Succinivibrio, Fusobacterium |
skupina 7 |
bakterije koje reduciraju sulfate i sumpor
Desulfovibrio, Desulfomonas, Desulfobakter |
skupina 8 |
anaerobni, Gram‑negativni koki
Veillonella |
skupina 9 |
rikecije i klamidije
Rickettsia, Chlamydia |
skupina 10 |
anoksigene fototrofne bakterije
Chromatium, Rhodospirillum, Chlorobium |
skupina 11 |
oksigene fototrofne bakterije |
skupina 12 |
aerobne kemolitotrofne bakterije i srodni organizmi Nitrosomonas, Nitrobacter, Thiobacillus, Acidiphilium |
skupina 13 |
pupajuće bakterije |
skupina 14 |
bakterije u tokovima
Sphaerotilus |
skupina 15 |
klizajuće nefotosintetske bakterije bez plodišta
Beggiatoa |
skupina 16 |
klizajuće bakterije s plodištima (miksobakterije)
Myxococcus |
skupina 17 |
Gram‑pozitivni koki
Peptococcus, Peptostreptococcus, Enterococcus, Staphylococcus, Micrococcus, Streptococcus |
skupina 18 |
endosporogeni Gram‑pozitivni štapići i koki
Bacillus, Clostridium |
skupina 19 |
pravilni nesporogeni Gram‑pozitivni štapići
Lactobacillus |
skupina 20 |
nepravilni nesporogeni Gram‑pozitivni štapići
Corynebacterium, Propionibacterium, Actinomyces |
skupina 21 |
mikobakterije
Mycobacterium |
skupine 22–29 |
aktinomiceti (nokardioformne aktinomicete, rodovi s višestrukim sporangijima, aktinoplanti, streptomicete, madurmiceti, termomonospore, termoaktinomicete i ostali rodovi) |
skupina 30 |
mikoplazme (molikute)
Mycoplasma |
skupina 31 |
oksigene fototrofne bakterije |
skupina 32 |
prastare (arhealne) bakterije koje reduciraju sulfate |
skupina 33 |
aerofilne arheobakterije (halobakterije)
Halobacterium |
skupina 34 |
arheobakterije bez stanične stijenke |
skupina 35 |
iznimno termofilne i hipertermofilne bakterije koje metaboliziraju sumpor |